A filogenetikai fa - Lyme-kór

Lyme-kór egy csapás baktérium által okozott Borrelia burgdorferi , a kórokozó által továbbított blacklegged kullancsok . Mint sok más kórokozók , biológusok sikerült megfejteni egy kicsit a B. burgdorferi evolúciós történetében a genetikai elemzés . A filogenetikai fa a baktérium , mint a B. burgdorferi ad vizuális illusztrációja a kapcsolatot más törzsekkel és fajok . A filogenetikai fák

A filogenetikai fa mutatja evolúciós kapcsolatokat a különböző fajok . Minden " node" a fán jelenti , hogy kialakult egy új faj , és ha a két faj tudja vezetni a családfáját vissza, egy pont, ez a csomópont képviseli a legutóbbi időpontban, hogy a két faj közös volt az őse. Ezek a fák gyártása során fizikai és genetikai jellemzők , valamint az evolúciós biológusok gyakran arra kényszerülnek , hogy módosítsa azokat az új adatok kerülnek napvilágra .
Borrelia

Borrelia valójában egy nemzetség a baktérium , amely magában foglalja több faj . A Borrelia fajok száma nőtt többször az elmúlt két évtizedben több törzset azonosítottunk . Meghatározása a Borrelia faj , vagy bármely más nemhez tartozó baktériumok valójában egy nagyon bonyolult probléma. Ha a növények és állatok tekintetében , biológusok hagyományosan meghatározott fajok alapján nem képes szaporodni , és termékeny utódokat . A ló és a szamár is szaporodnak, például, de az öszvér , hogy az eredmények steril , így a lovak és szamarak külön faj. A baktériumok azonban szaporodnak ivartalanul , így ez a meghatározás nem lényeges. Következésképpen , a Borrelia és sok más baktériumok , mikrobiológusok határozza fajok megkülönböztetve alapján a technika az úgynevezett teljes DNS-DNS hibridizáció .
Kapcsolatok

tudósok épített filogenetikai fák Borrelia fajok alapján a technika az úgynevezett multilokusz szekvencia analízis ( MLSA ), amely úgy néz ki, a különbség a speciális " takarítás " gének jelen lévő összes különböző faj. A biológusok használja ezt a szoftvert építeni a " leginkább takarékos fa" - A filogenetikai fa igényli a legkevesebb evolúciós változások megmagyarázni a megfigyelt különbségek . Eredményei ezt a módszert , azonban gyakran kell finomítani , ha új információk állnak rendelkezésre .
Kapcsolatok

Jelenleg B. burgdorferi sensu stricto osztja legutóbbi közös őse a B. bissettii ; két pedig egy közös őse B. lusitaniae . Mindhárom faj eltért egy közös őse , hogy ossza meg B. afzelii , B. spielmanii , B. garinii és B. bavariensis . Ez a csoport a faj viszont eltért a közös őstől közös B. valaisiana . Fontos megjegyezni azonban , hogy ez a filogenetikai fa nagyon is változni a jövőben új adatok derül fény . Különösen ez nagyon is lehetséges , hogy a csökkenő költségek genom szekvenálás hatással lehet a mód, ahogyan filogenetikai fákat kifejlesztett baktérium , mint a B. burgdorferi .